在唐玄宗到宪宗的时候，百丈怀海（720～814）禅师制定了清规。很多人以为禅宗是特别中国化的佛教宗派，它标举不立文字，教外别传，直指人心，见性成佛。其行事往往特立独行，脱略不羁。到了百丈时期，更是因他住于律寺之中，而感到对禅宗“说法住持，未合轨度，故常尔介怀”，从而别创禅林，制立清规。百丈清规制定之后的几百年间，就出现了十几种清规，历代丛林依百丈清规为蓝本，作了一些权宜性的增减，到元代至元年间（1335～1340），奉敕重修，称为敕修百丈清规。迄今近七百年间，百丈清规一直作为历代寺院的基本法规。
清规是中国禅宗寺院（丛林）组织的规程和寺众（清众）日常行事的章则，也可说是中世以来禅林创行的僧制。本来中国佛教从东晋道安首创僧尼规范三例以后，即随时有在戒律之外别立禁约之举，如支遁立众僧集仪度，慧远立法社节度，乃至梁武帝造光宅寺于金陵，命法云为寺主，创立僧制，用为后范，皆是其例（见《大宋僧史略》卷中《道俗立制》条）。到了中唐，禅宗盛行，百丈怀海禅师痛感禅僧住在律寺内，虽另处别院，但于说法住持，都不能合法。于是他于元和九年（814），别立禅居之制：尊“长老”为化主，处之“方丈”；不建佛殿，只树“法堂”，学众尽居“僧堂”，依受戒年次安排；设“长连床”，供坐禅偃息；閤院大众“朝参”“夕聚”，长老上堂，徒众侧立，宾主问答，激扬宗要；“斋粥”随宜，二时均遍；又行“普请”法，上下均力；事务分置十“寮”，置首领主管等等（见《景德传灯录》卷六末附《禅门规式》）。这些就成了丛林新例，与律法不同（见《僧史略》卷上《传禅规法》条）。世人即称为《百丈清规》。